D'origine arménienne, Arsinée Khanjian voit le jour au Liban, où ses grands-parents se sont réfugiés après le génocide commis sur le peuple arménien au début du siècle. Elle grandit à Beyrouth, puis émigre, avec sa famille, à Montréal, alors qu'elle a 17 ans. Elle y suit une formation de théâtre classique de trois ans, tout en faisant des études de lettres et de sciences politiques. En 1983, elle fait la rencontre d'Atom Egoyan pendant le casting du premier film de celui-ci, Next of Kin. C'est le coup de foudre, et la paire ne se quittera plus, dans la vie comme sur l'écran, la belle Arsinée devenant la muse du réalisateur. Elle sera de tous ses films, de la fille de la famille adoptive de Next of kin jusqu'à la traductrice de Calendar, en passant par la tenancière du bordel d'Exotica, dans lequel elle se montre nue et enceinte à la fois. Jusqu'à ce dernier film, la comédienne travaille parallèlement pour l'administration de l'Etat du Toronto, mais elle se dévoue bientôt à plein à sa carrière au cinéma.