Miles Morales est un adolescent vivant à Brooklyn, admirant Spider-Man comme de nombreux habitants. Élève brillant qui vient d'intégrer la prestigieuse académie Visions où il ne se sent pas à sa place, il subit cependant la pression de son père, l'agent de police Jefferson Davis qui ne veut pas le voir mal tourner et voit d'un mauvais oeil les agissements de Spider-Man. Miles trouve du soutien chez son oncle, Aaron Davis, qui l'accompagne dans une station de métro abandonnée pour que Miles puisse y poser un graffiti où l'adolescent se fait mordre par une araignée radioactive ....