En 1870, un jeune scientifique, Jamie Dodd (Joseph Fiennes), cherche à élucider le mystère de l'origine de l'homme. Il parcourt dans un but ethnologique les grands espaces africains, convaincu que c'est en étudiant les légendaires Pygmées, encore vierges de tout contact avec l'Occident, qu'il trouvera ce qu'il cherche.