Assistante de Tomas Gislason à 20 ans, Pernille Fischer Christensen s'inscrit à l'Ecole nationale de cinéma en 1993. Son film de fin d'études, un court métrage intitulé 'India', remporte plusieurs prix. Son deuxième court métrage, 'Habiti, My Love', qui sort en 2002, est également primé et obtient notamment le Danish Film Academy Award. En 2006, elle se lance dans le long métrage avec 'Soap' et remporte le prix du Meilleur premier film à la 56e Berlinade. Le film sort deux ans plus tard dans les salles française. Réalisatrice, Pernille Fischer écrit également les scripts de ses films.