Jean-Christophe Bouvet est né à Paris. Il prend des cours d'art dramatique chez Jean-Laurent Cochet au théâtre Edouard VII, il étudie le cinéma, la linguistique et la psychanalyse, à l'université de Paris VIII. Il rencontre Téchiné et Chabrol, dont il devient l'assistant. Il travaille simultanément en tant qu'acteur, assistant réalisateur et auteur.
Il tient son premier rôle important dans La Machine
Il incarne notamment ces personnages troubles, comme Pierre Lentier, l'assassin de La Machine