L'utilisation de l'énergie mana pour lutter contre l'invasion de Legion a considérablement affaibli la Terre. De nombreux œufs de Gyaos éclosent un peu partout dans le monde et les créatures commencent à proliférer. Gamera poursuit sa lutte contre ses ennemis héréditaires causant la mort de nombreuses personnes. L'armée est sur les dents et l'opinion publique se retourne contre Gamera. Une jeune fille voulant se venger de Gamera qui a tué ses parents découvre dans une grotte une étrange créature qu'elle baptise Irys.