Les choses ont tourné court pour Jonathan Graves. Mais comme dit le dicton, sur chacun tombe la pluie. Son père doit prendre la sorcellerie un peu trop au sérieux et, pour s'en libérer, il voulait enfoncer un pieu dans le coeur de Jonathan quand celui-ci était petit. Jonathan part donc à la recherche des maillons de son passé, aidé d'un vieux bonhomme et de son bébé spirit. Tous trois vont rencontrer une ménagerie de vermines surnaturelles qui vont bientôt les commander : les Ghoulies ....