Dans les eaux cristallines de la Grande Barrière de Corail, Marin, un poison clown, mène une existence paisible avec son fils unique, Nemo. Malgré les conseils et la surveillance de son papa poule, le jeune poisson intrépide n'attend qu'une occasion pour aller découvrir les mystères du monde. Lorsque vient le jour de quitter la sécurité de son foyer pour aller à l'école, Némo n'hésite pas : sa curiosité le pousse à s'approcher d'un bateau .... Un plongeur le capture sous les yeux horrifiés de son père.